其中顽疾，尤在‘福王长芦引’泛滥成灾！虽不宜直指藩王，但可严令盐运司彻查持此引商人实际运盐数量、路线、完税实数！凡超引、绕关、逃税者，盐船货物一律没收充公！课税加倍追缴！人犯严惩不贷！”
他稍作停顿，道出更深层改革：“‘积年旧引’阻滞新引，实乃盐法痼疾！
臣请旨：限半年内清理十年以上旧引，逾期作废！并准新引商人以旧引折价五成贴换新引，以此盘活引额，畅通官盐产销！”
另外“漕粮漂没半成已成常态，实属荒谬，可令漕运总督衙门及沿途各巡抚、巡按，对今年通州实收不足十四万石之湖广漕粮（原运三十万石），彻查各环节！
自起运仓大使、沿途各闸官、漕丁帮伙，至验收官员，凡查出克扣盘剥、谎报损耗者，除追回赃物外，家产罚没充公，其人重惩不贷，以儆效尤。”
“陛下，或可采用海运，以海运代替漕运，减轻漕运压力”毕自严话音刚落，徐光启便敏锐地捕捉到了推行新策的契机。
“臣斗胆再陈一事！方才毕大人剖析漕运之弊，一针见血。臣以为，欲通血脉，海运实为当务之急、切实可行之第一步！其利有三，有史实为证，绝非空谈！”
朱由校目光炯炯：“徐卿详述之！”
徐光启精神一振，以指轻叩案几，清晰条陈：
“其一，运力宏大而靡费剧减！陛下，漕运岁调四百万石，仅法定耗米达二十七万石、轻赍银十四万两，而沿途盘剥、过闸、盘坝等层层加耗，实际靡费远超此数！”
“反观海运，海船无需纤夫陆挽，不惧河道浅阻，不耗时日过闸！
臣查万历六年福建巡抚涂泽民曾遣海船自月港运粮二万石北上天津，耗费仅为同期等量漕运的三成五！其省费之巨，何止数十万两？”
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